（一）检疫处理的方式

1、除害：通过物理、化学和其他方法杀灭有害生物，包括熏蒸、消毒、高温、低温辐照等。

2、扑杀：对经检疫不合格的动物，依照法律规定，用不放血的方法进行宰杀，消灭传染源。

3、销毁：即用化学处理、焚烧、深埋或其他有效方法，彻底消灭病原体及其载体。

4、退回：对尚未卸离运输工具的不合格检疫物，可用原运输工具退回输出国；对已卸离运输工具的不合格检疫物，在不扩大传染的前提下，由原入境口岸在检验检疫机构的监管下退回输出国。

5、截留：对旅客携带的检疫物，经现场检疫认为需要除害或销毁的，签发《出人境人员携带物留验／处理凭证》，作为检疫处理的辅助手段。

封存：对需进行检疫处理的检疫物，应及时予以封存，防止疫情扩散，也是检疫处理的辅助手段。

此外，还有“不准出境”、“不准过境”等处理方式。

（二）检疫处理的程序

检疫处理的程序是口岸检验检疫机构根据检验检疫结果，对不合格的检疫物签发《检验检疫处理通知书》，通知货主或其代理人进行处理。检疫处理必须在检疫人员的监督下进行，检疫处理后，货主可根据需要向检验检疫机构申请出具有关对外索赔证书。